У меня Yamaha R1 1999 года, и она очень плохо заводится

Это 1-литровый 4-цилиндровый мотоцикл с независимыми карбюраторами. Маловероятно, что все 4 карбюратора засорились, если только мотоцикл не стоял без дела (стоял?).

Как уже упоминалось в другом комментарии, скорее всего, проблема в подаче топлива. Когда вы говорите, что двигатель глохнет, я предполагаю, что вы имеете в виду, что он с трудом заводится при открытии дроссельной заслонки.

Возможно, проблема также связана с зажиганием — судя по тому, как вы описываете ситуацию, проблема усугубилась, пока вы с ней боролись. Я бы предположил, что у вас слабая искра из-за неисправных свечей (их нужно довольно часто менять на мотоцикле с двигателем 1 л и соотношением сторон 12:1, который ревет как сумасшедший), а разряженный аккумулятор от многократных попыток завести мотоцикл не помог.

Вы нажимаете кнопку «не работает». Со временем двигатель заводился всё хуже и хуже? Скорее всего, вы разрядили аккумулятор, пытаясь завести машину снова и снова, но безуспешно.

Я мало что знаю о мотоциклах, но предполагаю, что топливо подаётся самотёком, а не с помощью топливного насоса. Если вы отсоединили шланги от карбюратора, вытекает ли бензин, если налить немного в бак? Кроме того, в месте, куда вы подключаете шланг, может быть какой-то фильтр из спечённой бронзы, который вы могли не заметить при чистке карбюратора.